Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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