Protein–RNA interactions for Protein: Q61663

Tlx2, T-cell leukemia homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx2Q61663 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx2Q61663 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms