Protein–RNA interactions for Protein: Q61500

Itm2a, Integral membrane protein 2A, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2aQ61500 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itm2aQ61500 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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