Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9a1Q61165 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a1Q61165 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms