Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp4Q60972 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms