Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClpbQ60649 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms