Protein–RNA interactions for Protein: Q60641

Nr1h4, Bile acid receptor, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h4Q60641 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1h4Q60641 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1h4Q60641 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms