Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms