Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tsr1Q5SWD9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms