Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc42Q5SV66 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms