Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ankrd40Q5SUE8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ankrd40Q5SUE8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms