Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1B6

Trav8d-2, T cell receptor alpha variable 8D-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav8d-2Q5R1B6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trav8d-2Q5R1B6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms