Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trdv2-2Q5R1A4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms