Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trdv4Q5R1A3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trdv4Q5R1A3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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