Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms