Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms