Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB3

Gm5431, Predicted gene 5431, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5431Q5NCB3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5431Q5NCB3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms