Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt2Q5DTW2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms