Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rtl5Q5DTT4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms