Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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