Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox3aQ4TU90 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox3aQ4TU90 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox3aQ4TU90 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox3aQ4TU90 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox3aQ4TU90 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox3aQ4TU90 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox3aQ4TU90 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox3aQ4TU90 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox3aQ4TU90 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox3aQ4TU90 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox3aQ4TU90 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox3aQ4TU90 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox3aQ4TU90 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox3aQ4TU90 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox3aQ4TU90 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox3aQ4TU90 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox3aQ4TU90 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox3aQ4TU90 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox3aQ4TU90 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox3aQ4TU90 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox3aQ4TU90 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox3aQ4TU90 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox3aQ4TU90 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox3aQ4TU90 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox3aQ4TU90 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox3aQ4TU90 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox3aQ4TU90 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox3aQ4TU90 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox3aQ4TU90 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox3aQ4TU90 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox3aQ4TU90 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox3aQ4TU90 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms