Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Lrrc43Q3V0L5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Lrrc43Q3V0L5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Lrrc43Q3V0L5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc43Q3V0L5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
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Lrrc43Q3V0L5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Lrrc43Q3V0L5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Lrrc43Q3V0L5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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Lrrc43Q3V0L5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Lrrc43Q3V0L5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Lrrc43Q3V0L5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Lrrc43Q3V0L5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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