Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Usp48Q3V0C5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Usp48Q3V0C5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp48Q3V0C5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp48Q3V0C5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Usp48Q3V0C5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Usp48Q3V0C5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Usp48Q3V0C5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Usp48Q3V0C5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Usp48Q3V0C5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp48Q3V0C5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp48Q3V0C5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp48Q3V0C5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp48Q3V0C5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp48Q3V0C5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp48Q3V0C5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp48Q3V0C5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp48Q3V0C5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp48Q3V0C5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp48Q3V0C5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp48Q3V0C5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp48Q3V0C5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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