Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Prdm6Q3UZD5 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm6Q3UZD5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Prdm6Q3UZD5 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm6Q3UZD5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm6Q3UZD5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm6Q3UZD5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm6Q3UZD5 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm6Q3UZD5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm6Q3UZD5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm6Q3UZD5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Prdm6Q3UZD5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm6Q3UZD5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Prdm6Q3UZD5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm6Q3UZD5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm6Q3UZD5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm6Q3UZD5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm6Q3UZD5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Prdm6Q3UZD5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm6Q3UZD5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm6Q3UZD5 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Prdm6Q3UZD5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Prdm6Q3UZD5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Prdm6Q3UZD5 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Prdm6Q3UZD5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm6Q3UZD5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm6Q3UZD5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm6Q3UZD5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm6Q3UZD5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Prdm6Q3UZD5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm6Q3UZD5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Prdm6Q3UZD5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Prdm6Q3UZD5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Prdm6Q3UZD5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm6Q3UZD5 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm6Q3UZD5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm6Q3UZD5 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm6Q3UZD5 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm6Q3UZD5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm6Q3UZD5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm6Q3UZD5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm6Q3UZD5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm6Q3UZD5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm6Q3UZD5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm6Q3UZD5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm6Q3UZD5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm6Q3UZD5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm6Q3UZD5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm6Q3UZD5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm6Q3UZD5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm6Q3UZD5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms