Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc114Q3UX62 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms