Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E330034G19RikQ3UWX6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms