Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca4bQ3UW98 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms