Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr1d1Q3UV55 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms