Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms