Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms