Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms