Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem253Q3UNB8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms