Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdgfl2Q3UMU9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms