Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc177Q3UHB8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc177Q3UHB8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc177Q3UHB8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc177Q3UHB8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc177Q3UHB8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc177Q3UHB8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc177Q3UHB8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc177Q3UHB8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc177Q3UHB8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc177Q3UHB8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc177Q3UHB8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc177Q3UHB8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc177Q3UHB8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc177Q3UHB8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc177Q3UHB8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc177Q3UHB8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc177Q3UHB8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc177Q3UHB8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc177Q3UHB8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc177Q3UHB8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc177Q3UHB8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc177Q3UHB8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc177Q3UHB8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc177Q3UHB8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc177Q3UHB8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc177Q3UHB8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc177Q3UHB8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc177Q3UHB8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc177Q3UHB8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc177Q3UHB8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc177Q3UHB8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc177Q3UHB8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc177Q3UHB8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ccdc177Q3UHB8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc177Q3UHB8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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