Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trafd1Q3UDK1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms