Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ssbp4Q3U4B1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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