Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hace1Q3U0D9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms