Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX08

Trmt1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1Q3TX08 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trmt1Q3TX08 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms