Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIU4

Pde12, 2',5'-phosphodiesterase 12, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde12Q3TIU4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde12Q3TIU4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde12Q3TIU4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde12Q3TIU4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde12Q3TIU4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde12Q3TIU4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde12Q3TIU4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde12Q3TIU4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde12Q3TIU4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde12Q3TIU4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde12Q3TIU4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde12Q3TIU4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde12Q3TIU4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde12Q3TIU4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde12Q3TIU4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde12Q3TIU4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde12Q3TIU4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde12Q3TIU4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms