Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fam107bQ3TGF2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms