Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp8Q2V6D6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms