Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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Gm1123Q1RME4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm1123Q1RME4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms