Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Myo3bQ1EG27 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms