Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps8Q0P5W1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms