Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms