Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms