Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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