Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MestQ07646 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MestQ07646 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MestQ07646 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MestQ07646 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MestQ07646 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MestQ07646 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MestQ07646 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MestQ07646 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MestQ07646 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MestQ07646 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MestQ07646 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MestQ07646 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MestQ07646 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MestQ07646 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MestQ07646 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MestQ07646 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MestQ07646 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MestQ07646 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MestQ07646 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MestQ07646 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MestQ07646 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MestQ07646 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MestQ07646 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MestQ07646 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MestQ07646 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MestQ07646 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MestQ07646 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MestQ07646 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MestQ07646 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MestQ07646 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MestQ07646 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MestQ07646 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MestQ07646 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MestQ07646 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MestQ07646 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MestQ07646 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MestQ07646 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MestQ07646 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MestQ07646 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MestQ07646 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MestQ07646 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MestQ07646 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MestQ07646 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MestQ07646 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MestQ07646 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MestQ07646 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MestQ07646 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MestQ07646 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MestQ07646 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MestQ07646 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MestQ07646 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MestQ07646 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MestQ07646 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MestQ07646 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MestQ07646 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MestQ07646 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MestQ07646 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MestQ07646 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MestQ07646 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MestQ07646 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MestQ07646 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MestQ07646 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MestQ07646 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MestQ07646 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MestQ07646 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MestQ07646 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MestQ07646 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MestQ07646 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MestQ07646 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MestQ07646 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MestQ07646 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MestQ07646 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MestQ07646 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MestQ07646 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MestQ07646 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MestQ07646 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MestQ07646 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MestQ07646 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MestQ07646 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MestQ07646 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MestQ07646 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MestQ07646 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MestQ07646 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MestQ07646 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MestQ07646 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MestQ07646 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
MestQ07646 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
MestQ07646 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
MestQ07646 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
MestQ07646 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
MestQ07646 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
MestQ07646 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
MestQ07646 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
MestQ07646 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
MestQ07646 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
MestQ07646 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
MestQ07646 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
MestQ07646 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
MestQ07646 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms