Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf4Q06507 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms