Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Prrx2Q06348 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Prrx2Q06348 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Prrx2Q06348 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Prrx2Q06348 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Prrx2Q06348 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Prrx2Q06348 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Prrx2Q06348 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Prrx2Q06348 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Prrx2Q06348 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Prrx2Q06348 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Prrx2Q06348 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Prrx2Q06348 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Prrx2Q06348 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Prrx2Q06348 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Prrx2Q06348 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Prrx2Q06348 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Prrx2Q06348 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Prrx2Q06348 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Prrx2Q06348 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Prrx2Q06348 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Prrx2Q06348 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Prrx2Q06348 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Prrx2Q06348 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Prrx2Q06348 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Prrx2Q06348 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Prrx2Q06348 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Prrx2Q06348 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Prrx2Q06348 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Prrx2Q06348 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Prrx2Q06348 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Prrx2Q06348 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Prrx2Q06348 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Prrx2Q06348 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Prrx2Q06348 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Prrx2Q06348 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Prrx2Q06348 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Prrx2Q06348 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Prrx2Q06348 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Prrx2Q06348 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms